رشته دکتری مهندسی شیمی گرایش بیوتکنولوژی کاربرد فرآیندهای زیستی در صنایع مختلف مرتبط با مهندسی شیمی را مورد مطالعه قرار می دهد. هدف این رشته تربیت متخصصانی است که علاوه بر مسایل مهندسی شیمی با اصول فرآیندهای زیستی هم آشنا باشند. فارغ التحصیلان رشته کارشناسی ارشد مهندسی شیمی گرایش بیوتکنولوژی می توانند در طراحی و یا راهبری واحدهای صنایع غذایی، دارویی، شیمیایی، محیط زیست و ...مرتبط با بیوتکنولوژی فعالیت کنند.