اصلی ترین وظیفه مهندس شیمی گرایش پالایش طراحی پالایشگاه ها می باشد. دانشجوی گرایش پالایش در پالایشگاه های کشور که نفت خام را به فرآورده های نفتی تبدیل می کنند، مشغول به کار شود.
گرایش پالایش به طراحی پالایشگاه ها باز می گردد. یعنی دانشجوی این گرایش شیوه طراحی دستگاه هایی مثل برجهای تقطیر، دستگاه های جداکننده مایعات از مایعات و گازها از مایعات را می آموزد. دستگاه هایی که مشتقات هیدروکربنی مثل بنزین و گازوئیل و مواد سنگین تر مثل قیر و شوینده ها را از نفت خام جدا ساخته و به دست می آورند.