در دوره دکترای مهندسی راه آهن گرایش کنترل و علائم، دانشجویان ضمن تدوین رساله دکتری (طرح پژوهشی) در زمینه کنترل سیستم ها و زیرسیستم های حوزه حمل و نقل ریلی و همچنین علائم و ارتباطات در سیستم های حمل و نقل ریلی با مباحث پیشرفته ای مانند سامانه های کنترل مشارکتی، اینترلاکینگ، سامانه های تشخیص قطار، کنترل کننده های هوشمند، سامانه الکترومغناطیس حرکت خطی و ... آشنایی کامل به دست می آورند. شرکت ها و سازمان های مربوط به حمل و نقل ریلی و مترو، مراکز تحقیقاتی و دانشگاه ها پذیرای فارغ التحصیلان دوره دکترای مهندسی راه آهن گرایش کنترل و علائم هستند.