با توجه به نقش بسیار زیاد صنعت ریلی در توسعه، امنیت و اقتصاد کشور و با عنایت به ویژگی های خاص این صنعت و نظر به سرمایه گذاری های عظیمی که برای رشد و توسعه شبکه ریلی در راه آهن و مترو اختصاص یافته است، لزوم و ضرورت تاسیس دوره کارشناسی ارشد مهندسی خطوط راه آهن برای انتقال دانش فنی لازم و آموزش و پژوهش جدی در این زمینه آشکار بوده و از اولویت بالایی برخوردار است.
هدف از دوره کارشناسی ارشد مهندسی خطوط راه آهن تربیت افرادی است که دارای توانائی های لازم جهت درک بهتر مسائل، برنامه ریزی و هدایت و طراحی و نظارت در پروژه های تخصصی در زمینه راه آهن و خطوط ریلی مختلف و توان تحقیقاتی مناسب و کافی جهت حل مسائلی که در این زمینه با آنها روبرو می شوند باشند. پروژه ها و تحقیقات مذکور می توانند در زمینه های رفتارسنجی روسازی و زیرسازی خطوط راه آهن، مدیریت خطوط راه آهن، ساخت و اجرای خطوط و نظایر آنها در راه آهن های معمولی، سبک، سریع السیر، برقی، شهری و مترو باشند. تربیت افرادی که بتوانند در توسعه و گسترش دانش فنی راه آهن در سطح آموزش عالی کشور مؤثر باشند از جمله اهداف و دستاوردهای دوره کارشناسی ارشد مهندسی خطوط راه آهن می باشد.