دكتري محيط زيست گرایشی از رشته مهندسی عمران است که با موضوعاتی نظیر عملکرد مواد شیمیایی و زیست‌شناسی موجودات، مباحث مربوط به اتلاف گرما و انرژی حرارتی، تصفیه و پالایش آب و هوا و اصلاح و بهبود مکان هائی که در اثر آسیب های قبلی و آلودگی های صنعتی صدمه دیده اند، در ارتباط می باشد. هدف دوره دكتري محيط زيست، افزايش اطلاعات کارشناساني نظير کارشناسان مهندسي عمران، مهندسي آب، مهندسي شيمي، مهندسي محيط زيست، مهندسي مکانيک، مهندسي بهداشت محيط و آموزش افرادي است که داراي توانائي هاي لازم جهت طراحي و نظارت برحسن اجراي پروژه هاي تخصصي در زمينه هاي مختلف مهندسي محيط زيست بوده و در ضمن قادر به انجام تحقيقات لازم جهت حل مسائل و مشکلات زيست محيطي کشور باشند. از جمله پروژه هاي تخصصي مرتبط با اين رشته می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:
- شناخت و کنترل آلودگي منابع آب، خاک و هوا
- طراحي تاسيسات آب و فاضلاب شهري، روستايي و صنعتي
- کنترل آلودگي هاي حاصل از مواد زائد جامد
- برنامه ريزی و مديريت اجراي طرح هاي زيست محيطي
- ارزيابي زيست محيطي طرح هاي عمراني