مهندسی پزشکی بالینی ، کاربرد تکنولوژی درمراقبت های بهداشتی در بیمارستان است. متخصصان مهندسی پزشکی بالینی همراه با گروهی متشکل از پزشکان، پرستارها و تکنسین ها یک تیم درمانی را تشکیل می دهند. مهندس پزشک بالینی مسئول خرید ،نگهداری ،تعمیر، بررسی اطلاعات کامپیوتری، تجهیزات پزشکی، ابزار کسب اطلاعات حیاتی و...است و همچنین تجهیزات مورد نیاز پزشکان و بیمارستان را در زمینه های خاص طراحی یا تطبیق می دهند.
مهندس پزشکی بالینی باید بتواند از سیستم های کامپیوتری و تجهیزات و نرم افزارهای طراحی شده برای کنترل این تجهیزات و جمع آوری اطلاعات و تجزیه و تحلیل آنها بهره گیرد.