رشته مهندسی کامپیوتر در مقطع کارشناسی ارشد دارای چهار گرایش معماری سیستم های کامپیوتری، هوش مصنوعی و رباتیکز، نرم افزار و الگوریتم و محاسبات می باشد و واحدهای درسی آن در مجموع 32 واحد است که شامل 6 واحد پایان نامه و 2 واحد سمینار و مابقی آن دروس اختصاصی الزامی، اختیاری و انتخابی می باشد.