مقطع دکتری مهندسی صنایع مجموعه‌ای آموزشی تحقیقاتی با تأکید بر آموزش های پیشرفته در مهندسی صنایع و تجزیه و تحلیل سیستم‌های صنعتی می‌باشد و هدف آن تربیت متخصصینی است که با بهره گیری از آموخته‌ها و دانش‌های مهندسی و دروس این مجموعه، توانایی شناخت و تحلیل و ارائه طرح برای سیستم‌های متشکل از انسان، مواد و ماشین را دارا باشند.
فارغ التحصیلان این دوره دارای مهارت های زیر خواهند بود:
• کشف و بررسی مشکلات وزارتخانه ها، سازمانهای ستادی و نظام های صنعتی
• جستجوی ارتباط منطقی بین اجزاء انواع سیستم های تولیدی و غیرتولیدی
• برنامه ریزی و ارائه مدل جهت کسب بهترین بازدهی از کارکرد سیستم ها
• کنترل سیستم ها جهت پیگیری نواقص و ارائه مدل مطلوب و نهایی
• برنامه ریزی و شرکت در اجرای پروژه های تحقیقاتی صنعتی
• ارائه الگوهای مناسب برای طراحی واحدهای تولیدی عظیم کشور
دكتراي صنايع برخلاف كارشناسي ارشد صنايع كه داراي گرايش هاي متنوعي است، تنها يك عنوان دارد، مهندسي صنايع، البته ممکن است برخی از دانشگاه ها فقط با عنوان گرایش خاصی اقدام به پذیرش دانسجوی دکترا نمایند.